На рынке можно встретить вагонку из лиственных пород (например, липы, ольхи, ясеня) или хвойных пород (чаще всего ели или сосны, реже — лиственницы, кедра). Вагонка первого типа используется в помещениях с высоким уровнем влажности, а также для наружных работ. Вагонкой второго типа отделывают жилые комнаты.
По сорту древесины (любой породы) вагонку также можно разделить на несколько групп. Так, самым высоким считается класс «Экстра», то есть доски без сучков и визуальных изъянов – неровностей, пятен, трещин. Далее идут три класса – А, В и С, из которых лучшим считается класс А (в нем также не должно быть трещин и смоляных кармашков, но допускается наличие одного живого сучка на каждые 1,5 м длины).
Вагонку можно также классифицировать по виду профиля. Так, существуют обычные доски и так называемая евровагонка, на которой на внутренней стороне досок делают вентиляционные каналы разной формы. Вагонка выпускается в разных размерах. В стандартном варианте толщина досок может варьировать в пределах 12-25 мм, а длина составляет до 6 м.